Tutorial_SNP - test
pos on chr 14 | score | NA06993 | NA07019 | NA07034 | NA07056 |
65357542 | 545 | GG (86) | AG (0) | AG (0) | AG (0) |
65358576 | 545 | AA (86) | AG (0) | AG (0) | AG (0) |
65391554 | 545 | GG (86) | GG (1) | GG (1) | GG (1) |
65546299 | 545 | CC (86) | CT (0) | CT (0) | CT (0) |
65563822 | 545 | GG (86) | GG (1) | GG (1) | GG (1) |
65564703 | 545 | TT (86) | GT (0) | GT (0) | GT (0) |
65644743 | 545 | GG (86) | GG (1) | GG (4) | AG (0) |
65645250 | 545 | CC (86) | CT (0) | CC (4) | CT (0) |
65697156 | 545 | AA (86) | AA (2) | AA (4) | AA (43) |
65930582 | 545 | TT (86) | TT (2) | TT (4) | TT (43) |
66046242 | 545 | GG (86) | CG (0) | CG (0) | GG (43) |
66058664 | 545 | AA (86) | AT (0) | AT (0) | AA (43) |
66087178 | 545 | AG (86) | AG (0) | GG (1) | AA (43) |
66126779 | 545 | TT (86) | TT (2) | CT (0) | TT (43) |
66168110 | 545 | AA (86) | AA (2) | AA (1) | AA (43) |
66219517 | 545 | CC (86) | CT (0) | CT (0) | CC (43) |
66344908 | 545 | CC (86) | CC (1) | CC (4) | CC (43) |
66346942 | 545 | CC (86) | CT (0) | CC (4) | TT (43) |
66381200 | 733 | CC (86) | CC (33) | CC (4) | CC (43) |
66518575 | 733 | CC (86) | CC (33) | CC (4) | CT (43) |
66535146 | 733 | GG (86) | GG (33) | CG (0) | GG (43) |
66578202 | 733 | GG (86) | GG (33) | GG (29) | GG (43) |
66578489 | 733 | GG (86) | GG (33) | GG (29) | GG (43) |
66645994 | 733 | GG (86) | GG (33) | GG (29) | GG (43) |
66701786 | 733 | TT (86) | TT (33) | TT (29) | TT (43) |
66704454 | 733 | TT (86) | TT (33) | TT (29) | TT (43) |
66733229 | 733 | CC (86) | CC (33) | CC (29) | CC (43) |
66733526 | 733 | GG (86) | GG (33) | GG (29) | GG (43) |
66780563 | 733 | GG (86) | GG (33) | GG (29) | GG (43) |
66780732 | 733 | AA (86) | AA (33) | AA (29) | AA (43) |
66880791 | 733 | TT (86) | TT (33) | TT (29) | TT (43) |
66880949 | 733 | CC (86) | CC (33) | CC (29) | CC (43) |
66881016 | 733 | AA (86) | AA (33) | AA (29) | AA (43) |
66958606 | 733 | GG (86) | GG (33) | GG (29) | GG (43) |
67066169 | 733 | CC (86) | CC (33) | CC (29) | CC (43) |
67103579 | 733 | CT (86) | CC (33) | CC (29) | CC (43) |
67106634 | 733 | TT (86) | TT (33) | TT (29) | TT (43) |
67107438 | 733 | CC (86) | CC (33) | CC (29) | CC (43) |
67298170 | 733 | GG (86) | GG (33) | GG (29) | GG (43) |
67315571 | 733 | TT (86) | TT (33) | TT (29) | TT (43) |
67385728 | 733 | AA (86) | AA (33) | AA (29) | AA (43) |
67526337 | 733 | TT (86) | TT (33) | TT (29) | TT (43) |
67527133 | 733 | AA (86) | AA (33) | AA (29) | AA (43) |
67527235 | 733 | TT (86) | TT (33) | TT (29) | TT (43) |
68103780 | 733 | CC (86) | CC (33) | CC (29) | CC (43) |
68105557 | 733 | CC (86) | CC (33) | CC (29) | CC (43) |
68117006 | 733 | CC (86) | CC (33) | CC (29) | CC (43) |
68117421 | 733 | AA (86) | AA (33) | AA (29) | AA (43) |
68123503 | 733 | TT (86) | TT (33) | TT (29) | TT (43) |
68181468 | 733 | AA (86) | AA (33) | AA (29) | AA (43) |
68255651 | 733 | AA (86) | AA (33) | AG (0) | AA (43) |
68257485 | 545 | CC (86) | CT (0) | CT (0) | CT (0) |
68277415 | 545 | AA (86) | AA (1) | AG (0) | AA (1) |
68343363 | 545 | AG (86) | AG (0) | GG (12) | AG (0) |
68425060 | 545 | TT (86) | CT (0) | CC (12) | CT (0) |
68459777 | 545 | TT (86) | TT (6) | TT (12) | TT (22) |
68677492 | 545 | CC (86) | CC (6) | CC (12) | CC (22) |
68689813 | 545 | GG (86) | GG (6) | GG (12) | GG (22) |
68698230 | 545 | TT (86) | TT (6) | TT (12) | TT (22) |
68699594 | 545 | GG (86) | GG (6) | GG (12) | GG (22) |
68786787 | 545 | TT (86) | TT (6) | TT (12) | TT (22) |
68788924 | 545 | AA (86) | AG (0) | AA (12) | AA (22) |
68788968 | 545 | CC (86) | CT (0) | CC (12) | CC (22) |
68835575 | 545 | TT (86) | TT (2) | TT (12) | TT (22) |
68836369 | 545 | TT (86) | TT (2) | TT (12) | TT (22) |
69031284 | 545 | TT (86) | AT (0) | AT (0) | AA (22) |
69055799 | 545 | GG (86) | GG (2) | AG (0) | GG (22) |
69131030 | 545 | CC (86) | CC (2) | CC (4) | CC (22) |
69194607 | 545 | CC (86) | CG (0) | CC (4) | CC (22) |
69230080 | 545 | AA (86) | AA (2) | AA (4) | AA (22) |
InDels are indicated as X.