Tutorial_SNP - hi2
pos on chr 17 | score | NA06993 | NA07019 | NA07034 | NA07056 |
43167863 | 600 | CC (6) | CC (41) | CC (24) | CC (48) |
43762255 | 600 | CT (0) | TT (41) | TT (24) | TT (48) |
43762594 | 600 | AT (0) | AA (41) | AA (24) | AA (48) |
43810371 | 600 | CG (0) | CC (41) | CC (24) | CC (48) |
43950976 | 600 | GT (0) | GG (41) | GG (24) | GG (48) |
43951717 | 600 | CT (0) | CC (41) | CC (24) | CC (48) |
43969779 | 600 | AC (0) | CC (41) | CC (24) | CC (48) |
44056833 | 600 | AG (0) | GG (41) | GG (24) | GG (48) |
44165098 | 600 | AG (0) | GG (41) | GG (24) | GG (48) |
44194735 | 600 | AC (0) | CC (41) | CC (24) | CC (48) |
44194835 | 600 | CT (0) | TT (41) | TT (24) | TT (48) |
44288579 | 600 | CT (0) | TT (41) | TT (24) | TT (48) |
44364829 | 600 | AC (0) | AA (41) | AA (24) | AA (48) |
44368404 | 600 | AG (0) | GG (41) | GG (24) | GG (48) |
44792632 | 600 | GG (1) | GG (41) | GG (24) | GG (48) |
44808902 | 600 | AG (0) | GG (41) | GG (24) | GG (48) |
45034002 | 600 | CT (0) | TT (41) | CC (24) | CT (0) |
45034021 | 600 | GG (1) | GG (41) | GG (24) | GG (1) |
45063349 | 600 | CT (0) | CC (41) | CT (0) | CT (0) |
45337949 | 863 | CC (27) | CC (41) | CT (0) | CT (0) |
45354493 | 863 | GG (27) | GG (41) | AG (0) | AG (0) |
45364807 | 863 | CC (27) | CC (41) | CC (5) | CC (6) |
45444868 | 863 | GG (27) | GG (41) | GG (5) | GG (6) |
45503539 | 863 | TT (27) | TT (41) | TT (5) | TT (6) |
45504870 | 863 | GG (27) | GG (41) | GG (5) | GG (6) |
45518193 | 863 | TT (27) | TT (41) | TT (5) | TT (6) |
45755810 | 263 | AG (27) | AG (0) | AG (0) | GG (6) |
45812124 | 263 | AA (27) | AG (0) | AA (2) | AG (0) |
45948412 | 263 | GG (27) | GG (6) | GG (2) | GG (4) |
46120767 | 263 | TT (27) | TT (6) | CT (0) | TT (4) |
46122125 | 263 | GG (27) | GG (6) | GT (0) | GG (4) |
46122270 | 263 | AA (27) | AA (6) | AA (1) | AA (4) |
46251391 | 263 | GG (27) | GG (6) | AG (0) | AG (0) |
46252502 | 263 | GG (27) | GG (6) | GT (0) | GG (1) |
46303558 | 263 | CC (27) | CT (0) | CC (9) | CT (0) |
46311935 | 263 | CC (27) | CC (1) | CC (9) | CT (0) |
46316234 | 263 | CG (27) | CG (0) | CC (9) | CC (1) |
46337573 | 263 | CC (27) | CT (0) | CC (9) | CT (0) |
46337925 | 263 | TT (27) | TT (5) | TT (9) | TT (3) |
46372573 | 263 | AA (27) | AA (5) | AA (9) | AA (3) |
46610879 | 263 | CC (27) | CC (5) | CC (9) | CC (3) |
46948218 | 263 | GG (27) | GG (5) | GG (9) | AG (0) |
47198243 | 263 | GG (27) | GG (5) | GG (9) | GG (4) |
47208076 | 263 | GG (27) | AG (0) | AG (0) | AA (4) |
47577839 | 263 | GG (27) | AA (14) | AG (0) | AA (4) |
47688526 | 263 | CC (27) | CC (14) | CC (2) | CC (4) |
InDels are indicated as X.