Tutorial_SNP - hi2
pos on chr 8 | score | NA06993 | NA07019 | NA07034 | NA07056 |
41302667 | 128 | GG (15) | GG (20) | GG (42) | GG (5) |
41567871 | 128 | CC (15) | CC (20) | CC (42) | CC (5) |
41595613 | 128 | AG (0) | GG (20) | GG (42) | AG (0) |
41601685 | 128 | CT (0) | TT (20) | TT (42) | CT (0) |
41658923 | 0 | AA (1) | AC (0) | AC (42) | CC (2) |
41746092 | 0 | CT (0) | CC (1) | TT (42) | CC (2) |
41807750 | 600 | AA (19) | AG (0) | AA (42) | AG (0) |
41860824 | 1200 | GG (19) | GG (35) | GG (42) | GG (12) |
41894717 | 1200 | TT (19) | TT (35) | TT (42) | TT (12) |
42027264 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (12) |
42208797 | 1200 | GG (19) | GG (35) | GG (42) | GG (12) |
42208964 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (12) |
42225183 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (12) |
42263157 | 1200 | TT (19) | TT (35) | TT (42) | TT (12) |
42428122 | 1200 | TT (19) | TT (35) | TT (42) | TT (12) |
43109570 | 1200 | GG (19) | GG (35) | GG (42) | GG (12) |
43304366 | 1200 | TT (19) | TT (35) | TT (42) | TT (12) |
43343518 | 1200 | TT (19) | TT (35) | TT (42) | TT (12) |
47245915 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (12) |
47723804 | 1200 | TT (19) | TT (35) | AA (42) | AT (0) |
47765411 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (2) |
47906634 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (2) |
47907503 | 1200 | AA (19) | AA (35) | GG (42) | AG (0) |
48710955 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (2) |
48737224 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (2) |
49289257 | 600 | AG (0) | AA (35) | AG (42) | AG (0) |
49358033 | 600 | AG (0) | GG (35) | GG (42) | GG (2) |
49484905 | 600 | CT (0) | CC (35) | CC (42) | CC (2) |
49589585 | 600 | TT (1) | TT (35) | TT (42) | CT (0) |
49590085 | 600 | AT (0) | AA (35) | AA (42) | AA (3) |
49677579 | 600 | CC (4) | CC (35) | CC (42) | CC (3) |
49678479 | 600 | AA (4) | AA (35) | AA (42) | AA (3) |
49861225 | 600 | CC (4) | CC (35) | CC (42) | CT (0) |
49950417 | 600 | CC (4) | CC (35) | CT (0) | CT (0) |
49950810 | 600 | AT (0) | AA (35) | AA (2) | AA (1) |
49969629 | 600 | AA (2) | GG (35) | AA (2) | AG (0) |
49991145 | 600 | AA (2) | AA (35) | AG (0) | AG (0) |
50023600 | 600 | AC (0) | AA (35) | AC (0) | AA (1) |
50035417 | 600 | CC (2) | CC (35) | CT (0) | CT (0) |
50035806 | 600 | GG (2) | GG (35) | AG (0) | AG (0) |
50060407 | 600 | CT (0) | TT (35) | CT (0) | TT (3) |
50061636 | 670 | AA (25) | AA (35) | AA (5) | AA (3) |
50105059 | 70 | GG (25) | CG (0) | GG (5) | GG (3) |
50140734 | 70 | AA (25) | GG (5) | AA (5) | AG (0) |
50188712 | 70 | AA (25) | GG (5) | AA (5) | AG (0) |
50244364 | 70 | CC (25) | AA (5) | CC (5) | AC (0) |
50244800 | 70 | GG (25) | AA (5) | AG (0) | AG (0) |
50261435 | 70 | GG (25) | GG (5) | AG (0) | GG (1) |
InDels are indicated as X.