Tutorial_SNP - hi2
| pos on chr 8 | score | NA06993 | NA07019 | NA07034 | NA07056 |
| 39819192 | 0 | GG (1) | GG (7) | CG (0) | GG (7) |
| 40010486 | 0 | CT (0) | CC (7) | CC (13) | CC (7) |
| 40010710 | 0 | GG (2) | GG (7) | GG (13) | GG (7) |
| 40069526 | 0 | GG (2) | GG (7) | CC (13) | GG (7) |
| 40069791 | 0 | AC (0) | AC (0) | CC (13) | AC (0) |
| 40071825 | 32 | CC (19) | CT (0) | CC (13) | CT (0) |
| 40091713 | 32 | TT (19) | TT (10) | TT (13) | TT (6) |
| 40091779 | 32 | CC (19) | CC (10) | TT (13) | CC (6) |
| 40092009 | 32 | AA (19) | AA (10) | GG (13) | AA (6) |
| 40092054 | 32 | CC (19) | CC (10) | CC (13) | CC (6) |
| 40092581 | 32 | CC (19) | CC (10) | TT (13) | CC (6) |
| 40154240 | 32 | GG (19) | GG (10) | GG (13) | GG (6) |
| 40154859 | 32 | AA (19) | AA (10) | AA (13) | AT (0) |
| 40203542 | 32 | AA (19) | AA (10) | AA (13) | AA (1) |
| 40221484 | 32 | CC (19) | CC (10) | CG (0) | CG (0) |
| 40221754 | 32 | GG (19) | GG (10) | GT (0) | GT (0) |
| 40285421 | 32 | CC (19) | CT (0) | CC (4) | CC (1) |
| 40303299 | 32 | CC (19) | CC (2) | TT (4) | CT (0) |
| 40304235 | 32 | TT (19) | TT (2) | AA (4) | AT (0) |
| 40305622 | 32 | CC (19) | CT (0) | TT (4) | CT (0) |
| 40312565 | 32 | GG (19) | AG (0) | AG (0) | AG (0) |
| 40313989 | 32 | GG (19) | GG (1) | AG (0) | GG (1) |
| 40335267 | 32 | AA (19) | AC (0) | CC (3) | AC (0) |
| 40382578 | 160 | TT (19) | TT (20) | TT (3) | TT (7) |
| 40382816 | 128 | CT (0) | CC (20) | TT (3) | CC (7) |
| 40382843 | 128 | AG (0) | GG (20) | AG (0) | GG (7) |
| 40446494 | 128 | AA (15) | AA (20) | AA (1) | AA (7) |
| 40446942 | 128 | GG (15) | AA (20) | AG (0) | AA (7) |
| 40448287 | 128 | CC (15) | GG (20) | CG (0) | GG (7) |
| 40448714 | 128 | AA (15) | GG (20) | AG (0) | GG (7) |
| 40462615 | 128 | CC (15) | CC (20) | CC (42) | CT (0) |
| 40466875 | 128 | AA (15) | AA (20) | AA (42) | AG (0) |
| 40467279 | 128 | GG (15) | GG (20) | GG (42) | AG (0) |
| 40467685 | 128 | TT (15) | TT (20) | TT (42) | CT (0) |
| 40480601 | 128 | GG (15) | GG (20) | GG (42) | GG (1) |
| 40480730 | 128 | CC (15) | CC (20) | CC (42) | CT (0) |
| 40722829 | 128 | CC (15) | CC (20) | CC (42) | CC (5) |
| 40723970 | 128 | AA (15) | AA (20) | AA (42) | AA (5) |
| 40740473 | 128 | GG (15) | GG (20) | GG (42) | GG (5) |
| 41302667 | 128 | GG (15) | GG (20) | GG (42) | GG (5) |
| 41567871 | 128 | CC (15) | CC (20) | CC (42) | CC (5) |
| 41595613 | 128 | AG (0) | GG (20) | GG (42) | AG (0) |
| 41601685 | 128 | CT (0) | TT (20) | TT (42) | CT (0) |
| 41658923 | 0 | AA (1) | AC (0) | AC (42) | CC (2) |
| 41746092 | 0 | CT (0) | CC (1) | TT (42) | CC (2) |
| 41807750 | 600 | AA (19) | AG (0) | AA (42) | AG (0) |
| 41860824 | 1200 | GG (19) | GG (35) | GG (42) | GG (12) |
| 41894717 | 1200 | TT (19) | TT (35) | TT (42) | TT (12) |
| 42027264 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (12) |
| 42208797 | 1200 | GG (19) | GG (35) | GG (42) | GG (12) |
| 42208964 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (12) |
| 42225183 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (12) |
| 42263157 | 1200 | TT (19) | TT (35) | TT (42) | TT (12) |
| 42428122 | 1200 | TT (19) | TT (35) | TT (42) | TT (12) |
| 43109570 | 1200 | GG (19) | GG (35) | GG (42) | GG (12) |
| 43304366 | 1200 | TT (19) | TT (35) | TT (42) | TT (12) |
| 43343518 | 1200 | TT (19) | TT (35) | TT (42) | TT (12) |
| 47245915 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (12) |
| 47723804 | 1200 | TT (19) | TT (35) | AA (42) | AT (0) |
| 47765411 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (2) |
| 47906634 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (2) |
| 47907503 | 1200 | AA (19) | AA (35) | GG (42) | AG (0) |
| 48710955 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (2) |
| 48737224 | 1200 | AA (19) | AA (35) | AA (42) | AA (2) |
| 49289257 | 600 | AG (0) | AA (35) | AG (42) | AG (0) |
| 49358033 | 600 | AG (0) | GG (35) | GG (42) | GG (2) |
| 49484905 | 600 | CT (0) | CC (35) | CC (42) | CC (2) |
| 49589585 | 600 | TT (1) | TT (35) | TT (42) | CT (0) |
| 49590085 | 600 | AT (0) | AA (35) | AA (42) | AA (3) |
| 49677579 | 600 | CC (4) | CC (35) | CC (42) | CC (3) |
| 49678479 | 600 | AA (4) | AA (35) | AA (42) | AA (3) |
| 49861225 | 600 | CC (4) | CC (35) | CC (42) | CT (0) |
| 49950417 | 600 | CC (4) | CC (35) | CT (0) | CT (0) |
| 49950810 | 600 | AT (0) | AA (35) | AA (2) | AA (1) |
| 49969629 | 600 | AA (2) | GG (35) | AA (2) | AG (0) |
| 49991145 | 600 | AA (2) | AA (35) | AG (0) | AG (0) |
| 50023600 | 600 | AC (0) | AA (35) | AC (0) | AA (1) |
| 50035417 | 600 | CC (2) | CC (35) | CT (0) | CT (0) |
| 50035806 | 600 | GG (2) | GG (35) | AG (0) | AG (0) |
| 50060407 | 600 | CT (0) | TT (35) | CT (0) | TT (3) |
| 50061636 | 670 | AA (25) | AA (35) | AA (5) | AA (3) |
| 50105059 | 70 | GG (25) | CG (0) | GG (5) | GG (3) |
| 50140734 | 70 | AA (25) | GG (5) | AA (5) | AG (0) |
| 50188712 | 70 | AA (25) | GG (5) | AA (5) | AG (0) |
| 50244364 | 70 | CC (25) | AA (5) | CC (5) | AC (0) |
| 50244800 | 70 | GG (25) | AA (5) | AG (0) | AG (0) |
| 50261435 | 70 | GG (25) | GG (5) | AG (0) | GG (1) |
| 50306115 | 70 | TT (25) | CT (0) | TT (3) | CT (0) |
| 50306236 | 70 | CC (25) | CT (0) | CC (3) | CT (0) |
| 50306276 | 70 | TT (25) | CT (0) | TT (3) | CT (0) |
| 50306294 | 70 | CC (25) | CT (0) | CT (0) | CC (3) |
| 50306507 | 70 | TT (25) | TT (2) | TT (6) | TT (3) |
| 50350244 | 70 | CC (25) | CC (2) | CC (6) | CC (3) |
| 50350870 | 70 | CC (25) | CT (0) | CC (6) | CT (0) |
| 50360286 | 70 | AA (25) | AA (1) | AA (6) | AA (1) |
| 50402075 | 70 | CC (25) | CT (0) | CC (6) | CT (0) |
| 50402183 | 70 | GG (25) | CG (0) | GG (6) | CG (0) |
| 50535861 | 70 | CC (25) | AC (0) | AC (0) | CC (1) |
| 50536308 | 70 | TT (25) | CT (0) | TT (4) | CT (0) |
| 50551984 | 70 | GG (25) | CG (0) | GG (4) | CG (0) |
| 50595067 | 70 | GG (25) | GT (0) | GG (4) | GT (0) |
| 50595263 | 70 | AA (25) | AG (0) | AA (4) | AG (0) |
| 50605610 | 70 | TT (25) | CT (0) | CT (0) | TT (3) |
| 50605655 | 70 | AA (25) | AG (0) | AG (0) | AA (3) |
| 50654234 | 154 | GG (25) | GG (21) | GG (15) | GG (3) |
| 50757060 | 84 | AG (0) | GG (21) | GG (15) | AG (0) |
| 50760776 | 84 | CT (0) | CC (21) | CC (15) | CC (1) |
| 50777948 | 84 | GG (1) | TT (21) | TT (15) | GT (0) |
| 50781978 | 84 | AT (0) | TT (21) | TT (15) | AT (0) |
| 50812611 | 84 | AC (0) | CC (21) | CC (15) | CC (2) |
| 50867869 | 84 | GG (2) | GG (21) | GG (15) | GG (2) |
| 50868176 | 84 | CC (2) | AA (21) | AA (15) | AC (0) |
| 50868370 | 84 | AG (0) | GG (21) | GG (15) | AG (0) |
| 50887804 | 84 | AA (15) | GG (21) | GG (15) | AG (0) |
| 50913292 | 84 | TT (15) | CC (21) | CC (15) | CT (0) |
| 50930075 | 84 | GG (15) | GG (21) | GG (15) | GG (10) |
| 50948893 | 84 | CC (15) | CC (21) | CC (15) | CC (10) |
| 50989101 | 84 | GG (15) | AA (21) | AA (15) | AA (10) |
| 51047383 | 84 | GG (15) | CC (21) | CC (15) | CC (10) |
| 51052035 | 84 | AA (15) | CC (21) | AC (0) | CC (10) |
| 51089642 | 84 | CC (15) | GG (21) | CG (0) | GG (10) |
| 51154344 | 84 | TT (15) | CC (21) | CT (0) | CC (10) |
| 51220552 | 84 | TT (15) | TT (21) | TT (2) | TT (10) |
| 51222048 | 84 | GG (15) | GG (21) | GG (2) | GG (10) |
InDels are indicated as X.
